딥러닝을 이용한 약물 화학 구조 예측

초록

신약 개발에 필요한 시간과 비용을 줄이기 위해서 많은 컴퓨터 기반 방법들이 연구되고 있다. 특히 최근 딥러닝 기법의 발전과 함께 후보 화합물의 화학식을 생성하기 위한 여러 가지 생성 모델 (Generative model) 및 조건에 맞는 화학식을 생성하기 위한 강화학습 모델(Reinforcement learning model) 이 많이 연구되고 있다. 본 논문에서는 화합물과 단백질 간의 예측된 결합 친화력 정보를 이용한 강화학습 모델을 제시한다. 구체적으로, 본 논문에서 사용하고 있는 생성 모델은 Stack-RNN이며, 생성된 화학식이 특정한 화학적 특성을 가짐과 동시에 특정한 단백질과 높은 결합 친화력을 가지도록 Stack-RNN을 에이전트로 이용함으로써 강화학습을 구현한다. 본 논문에서는 소라페닙(Sorafenib), 수니티닙(Sunitinib), 다사티닙(Dasatinib)의 3가지 항암제들이 가지는 표적 단백질 정보를 이용하여 해당 항암제와 유사한 화합물의 화학식을 생성해 보았다.

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